Barrapunto

Os estáis desviando totalmente del tema. Como ha dicho Pobrecito Hablador más arriba, GNU/Linux (hablando de forma genérica) no viene "por defecto" con el sistema gráfico. Pero en GNU/Linux hay distribuciones y la mayoría de ellas te deja hacer una instalación "fácil" en la que se instalan las X y un entorno de escritorio. Con este entorno de escritorio vienen muchas librerías que se supone se van a usar por el común de los programas y otras no vienen.

Asi pues, las compartidas vienen o no vienen con el sistema operativo, pero las aplicaciones no deberin poder añadir librerias propias al repositorio comun.

No veo ninguna razón para lo que dices. Si una librería es a la vez susceptible de no ser usada y de ser usada por más de un programa, ¿por qué instalarla con el sistema? ¿por qué no dejar al primer programa que vaya a utilizarla (sistemas de control de dependencias) que la instale en un repositorio común?