Barrapunto

"O sea, ¿que tenemos un registro de windows encubierto?...."

No, solo la configuracion de Gnome esta metida en esos "registros".

"Para quitar la flechita de los enlaces vete a

gnome_key_software/{asjhksad-dsflkj1930-dsfsdfl}/h ide_arrow=true "

Tampoco, No estan estructurados de esa forma, no existe secciones de los registros con nombres cripticos como en tu ejemplo.

"Me gusta más la idea de editar los ficheros de texto en /etc que tener un registro centralizado."

¿Y? Cual es el problema, siguen siendo ficheros de texto, XML . Por otro lado Con estos pseudoregistros solo se configura el comportamineto de Gnome , por lo que el directorio /etc queda intacto.